开始新游戏后,玩家需要先后选择游戏难度和游戏模式。
普通难度(Normal): 敌人数量较少,能力值较低,AI不会利用攻阵增加输出。遭遇战的花费较低。
困难难度(Hard): 敌人数量适中,能力值适中,AI会利用攻阵增加输出。遭遇战的花费较高。
疯狂难度(Lunatic):敌人数量更多,能力值更高,并携带大量特技,AI会利用攻阵增加输出。遭遇战的花费较高。
本作就这3档难度,不存在隐藏难度。
涅槃模式,或称凤凰模式(Phoenix):if新增的模式,比Casual模式进一步降低了游戏难度,使战棋苦手的火纹爱好者不至于被难度吓倒。我方死亡角色在下一个我方回合开始时,就会原地满血复活(但这并不意味着玩家就绝对不会Game Over了,如果在一回合内被全灭,或没能完成某些章节的限时任务,仍然会……),另外,敌方不会组成攻阵、防阵。游戏过程中可随时存档。
休闲模式(Casual):火纹从NDS时代开始出现的模式,推翻了火纹长期以来“人死不能复生”的残酷设定,我方死亡角色将在过了本关后复活。另外,主角死亡并不会立刻Game Over。游戏过程中可随时存档。
经典模式(Classic):火纹的经典设定,充分体现出战争的残酷性:人死不能复生,主角死亡直接Game Over。游戏过程中只能随时“中断”,从中断点重新读取游戏时,中断存档将被立刻删除,也就是说中断功能仅供玩家暂时离开游戏,无法利用它从章节的中途反复开始游戏,玩家必须连贯地完成一章的挑战。
第6章之后,玩家可在大地图的菜单选择“难易度变更”,随时调整游戏难度,但只能越调越容易,无法逆转。
困难和疯狂难度下,无法调整游戏模式。普通难度下,可以在涅槃和休闲模式之间随意切换。